Здание церкви находится во внутреннем дворе институтского комплекса. Это отдельное трехэтажное здание, построенное в традициях русского классицизма . С главным корпусом соединено переходом. Внешний вид фасадов сохранился, только в фронтоне вместо исторического барельефа в советское время появился герб СССР.

Проект здания церкви разработал в 1829 г. архитектор Д.Квадри. После его смерти в 1832 году строительством руководил П.С. Плавов, который переработал первоначальный проект. Работы были закончены в 1834 году. В феврале 1834 года церковь была освящена во имя Покрова Пресвятой Богородицы.

После революции весь комплекс зданий Николаевского сиротского института отошел к Педагогическому институту (ныне РГПУ имени А.И. Герцена). В церкви был устроен клуб.

Литература: Длужневская Г.В. Утраченные храмы Петербурга. - СПб,: Издательский Дом "Литера" 2003